2003年、7月より新設された。アメリカンフットボール部とよく似た競技で、中学生向けのルールで行うのがフラッグフットボールです。 フラッグフットボールは、自分たちで作戦を考え、実行するスポーツで教育的に有意義であるという理由から小学校でも授業に採用している学校が増えています。
2010年度、秋季フラッグフットボール選手権関東南地区大会で、麻布中学校Aチーム（中学3年生）が準優勝しました。写真はこちら。
下は2009年度の写真です。2008年度の写真はこちら。
